強(qiáng)化學(xué)習(xí):從棋盤游戲到蛋白質(zhì)設(shè)計
科技日報北京4月20日電 (記者張夢然)科學(xué)家已成功將強(qiáng)化學(xué)習(xí)應(yīng)用于分子生物學(xué)的挑戰(zhàn):美國華盛頓大學(xué)研究人員開發(fā)出一款功能強(qiáng)大的新型蛋白質(zhì)設(shè)計軟件,該軟件改編自一種被證明擅長棋盤游戲(如國際象棋和圍棋)的策略。實驗發(fā)現(xiàn),用新方法制造的蛋白質(zhì)能更有效地在小鼠體內(nèi)產(chǎn)生有用抗體。發(fā)表在最新一期《科學(xué)》雜志上的研究結(jié)果,可能會很快帶來更有效的疫苗。
強(qiáng)化學(xué)習(xí)是一種機(jī)器學(xué)習(xí),其中計算機(jī)程序通過嘗試不同的動作和接收反饋來學(xué)習(xí)作出決策。例如,這樣的算法可通過導(dǎo)致勝敗的數(shù)百萬種不同動作來學(xué)習(xí)下國際象棋。
為了開發(fā)用于蛋白質(zhì)設(shè)計的強(qiáng)化學(xué)習(xí)程序,研究人員為計算機(jī)提供了數(shù)百萬個簡單的起始分子。然后,該軟件進(jìn)行了一萬次嘗試,隨機(jī)改進(jìn)每一個以達(dá)到預(yù)定義的目標(biāo)。計算機(jī)將蛋白質(zhì)加長或以特定方式彎曲它們,直到學(xué)會如何將它們扭曲成所需的形狀。
作為這項研究的一部分,研究人員在實驗室制造了數(shù)百種人工智能設(shè)計的蛋白質(zhì)。使用電子顯微鏡和其他儀器,他們證實計算機(jī)創(chuàng)建的許多蛋白質(zhì)形狀確實在實驗室中實現(xiàn)了。研究證明,這種方法不僅準(zhǔn)確,而且可定制,制作出無孔、小孔或大孔的球形結(jié)構(gòu)。
該團(tuán)隊專注于設(shè)計由許多蛋白質(zhì)分子組成的新型納米級結(jié)構(gòu)。這需要設(shè)計蛋白質(zhì)成分本身和允許納米結(jié)構(gòu)自組裝的化學(xué)界面。為了衡量設(shè)計軟件的準(zhǔn)確性,研究人員觀察了許多獨(dú)特的納米結(jié)構(gòu),其中每個原子都位于預(yù)期的位置。換句話說,預(yù)期和實際納米結(jié)構(gòu)之間的偏差平均小于單個原子的寬度。
在未來,這種方法能夠創(chuàng)造出使用以前的方法無法制造的治療性蛋白質(zhì)、疫苗和其他分子。研究人員使用血管細(xì)胞的原代細(xì)胞模型表明,設(shè)計的蛋白質(zhì)支架優(yōu)于該技術(shù)的先前版本。由于幫助細(xì)胞接收和解釋信號的受體更密集地聚集在更緊湊的支架上,它們在促進(jìn)血管穩(wěn)定性方面更有效。
【總編輯圈點】
這是一項AI推進(jìn)蛋白質(zhì)科學(xué)進(jìn)展的里程碑式研究。其潛在的應(yīng)用從開發(fā)更有效的癌癥治療藥物,到創(chuàng)造新的可生物降解的紡織品,可以說價值巨大。而更深層次的意義,在于它證明了強(qiáng)化學(xué)習(xí)可做的不僅僅是掌握棋盤游戲,在解決科學(xué)中長期存在的難題時,強(qiáng)化學(xué)習(xí)同樣表現(xiàn)出色。如果將這種方法應(yīng)用于解決問題,它還能加速多項科學(xué)領(lǐng)域的進(jìn)步。
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